Tại cuộc họp, nhiều ý kiến đều đề cập đến việc đấu thầu thuốc tại các bệnh viện. Hiện nay, phương thức cung ứng thuốc vẫn qua hình thức đấu thầu (đấu thầu rộng rãi; đấu thầu hạn chế; chỉ định thầu). Mỗi bệnh viện sẽ áp dụng cách thức đấu thầu riêng của mình. Trong khi đó, Bộ Y tế chưa có văn bản hướng dẫn tổ chức đấu thầu thống nhất trong cả nước. Việc đấu thầu thuốc khác nhau dễ dẫn đến gía thuốc ở mỗi địa phương cũng khác nhau. Đó là chưa kể đến việc tiền mua thuốc chưa thanh toán dứt điểm, khiến cho lúc giá thuốc trên thị trường biến động đã buộc bệnh viện phải tăng giá thuốc vì doanh nghiệp cung ứng thuốc tính giá cao hơn so với thời điểm nợ.

Trước tình hình giá thuốc trên thị trường liên tục biến đổi, đại diện Bộ Y tế cho biết: Theo dự thảo quy chế, việc cung ứng thuốc cho bệnh viện sẽ được tổ chức đấu thầu tập trung trong thời gian sáu tháng hoặc một năm. Đến tháng 6/2004, Bộ Y tế sẽ cùng Bộ Tài chính đưa ra văn bản thống nhất hướng dẫn đấu thầu thuốc trong bệnh viện. Các bệnh viện trung ương sẽ chủ động đấu thầu, còn bệnh viện tuyến dưới do Sở Y tế đảm nhiệm.

Đại diện nhiều bệnh viện đều đề xuất phải có một khung giá sàn, chống độc quyền trong nhập khẩu thuốc; có các quy định về thanh - kiểm tra việc kê đơn, bán thuốc theo đơn và kê đơn theo tên gốc cùng các giải pháp chống độc quyền - cụ thể là quy định về nhập khẩu song song và nhập khẩu thuốc chuyên dụng. Cũng có ý kiến cho rằng Việt Nam nên chủ động việc sản xuất và tự cung ứng thuốc, không nên nhập khẩu của nước ngoài nhiều.

Tại cuộc họp, Bộ Y tế cũng đưa ra danh mục 177 loại thuốc thiết yếu thuộc danh mục Nhà nước quản lý giá để lấy ý kiến của đại diện các bệnh viện.